1998
El 27 de enero, Abliz Haji, miembro del Comité Ejecutivo del Comité del Dsitrito de Yecheng del CPPCC y también imán de la Gran Mezquita del mismo distrito es tiroteado por terroristas y resulta muerto.
Del 30 de enero al 18 de febrero, miembros de la Organización para la Liberación del Turquestán Oriental son encontrados culpables de 23 casos de envenenamiento, uno de los cuales resultó finalmente muerto y otros cuatro más gravemente enfermos, en la ciudad de Kashgar.
Del 22 de febrero al 30 de marzo, la misma organización se responsabilizó de seis explosiones en el distrito de Yecheng, de la prefectura de Kashgar, que dejó como resultado tres heridos y la explosión de un gaseoducto que acabó en incendio.
El 5 de marzo, terroristas de esta organización perpetraron un atentado con explosivos contra el Consulado General de China en Estambul.
El 23 de mayo, con más de 40 aparatos incendiarios, los terroristas intentaron provocar incendios de forma simultánea en 15 lugares de intensa actividad comercial.
El 7 de abril, la misma organización provocó ocho explosiones sucesivas en diferentes lugares, entre ellos, las viviendas del director del Buró de Seguridad Pública del distrito de Yecheng, el vicepresidente del Comité del CPPCC del mismo distrito y el vice comisionado de la prefectura de Kashgar. Las explosiones provocaron ocho heridos.
1999
El 23 de agosto, una docena de terroristas liderados por Yasin Muhammat irrumpieron en la residencia de Hudaberdi Tohti, instructor político de la comisaría de policía del pueblo de Bosikem del distrito de Zepu, prefectura de Kashgar, causando la muerte de éste por arma blanca y la de su hijo como consecuencia de un disparo. Tras el asesinato, prendieron fuego a la casa provocando quemaduras de gravedad a su esposa.
El 11 de octubre, tres terroristas prendieron fuego a varias pilas de algodón en el centro de compras de la ciudad del algodón de Hotan y la empresa Hemp.
El 24 de octubre, varios terroristas atacaron la comisaría de policía de la ciudad de Saili, ene l distrito de Zepu, armados con pistolas, machetes, bombas caseras y granadas. Dispararon a un miembro de las fuerzas de seguridad locales e hirieron a otro, así como a un policía. Por último, mataron a un criminal que se hallaba retenido en custodia, e incendiaron diez salas de la comisaría, un todoterreno y tres motocicletas.
2000
El 25 de enero, varios terroristas acorralaron a dos familias de etnia han en el distrito de Wushi, resultando el ataque en la muerte de siete personas y dos heridos. El miembro más joven tenía tan sólo dos años.
El 26 de enero, los terroristas acabaron con al vida de un hombre de 60 años de la etnia han en el distrito de Xinhe.
En marzo, Nighmet Bosakof, presidente de la Alianza de la Juventud Uigur de Kyrgyzstan, murió como consecuencia de un disparo efectuado por miembros de la Organización para la Liberación del Turquestán Oriental ante su negativa a cooperar con dicha organización.
En mayo, miembros de la misma organización consiguieron un rescate de 100.000 dólares americanos por el secuestro de un empresario de Xinjiang, después de matar a su sobrino y prender fuego al Mercado de Productos Chinos de Bishkek. El 25 de mayo, los terroristas atacaron a un equipo de trabajo del gobierno regional de Xinjiang que se había desplazado a Kyrgyzstan para ocuparse del caso, causando un muerto y dos heridos. Los culpables escaparon entonces a Kazakhstan, matando en su huída a dos policías de ese país que los estaban buscando en Alma-Ata en septiembre del mismo año.
2001
El 3 de febrero, una banda de terroristas irrumpió en la vivienda de Muhammatjan Yaqup, un oficial del Juzgado del Pueblo del distrito de Shufu, en la prefectura de Kashgar, causando su muerte.
2002
El 29 de junio, Wang Jianping, el Primer Secretario de la Embajada China en Kyrgyzstan y otro ciudadano chino fueron asesinados en Bishkek.
2003
El 27 de marzo, hombres armados atacaron un convoy turístico que recorría la ruta entre China y Kyrgyzstan, matando a 21 personas, 18 de las cuales eran de nacionalidad china.
2006
El 15 de diciembre, una bomba en el Hospital Número 1 de los Niños de Urumqi provocó dos heridos.
2007
En enero, la policía desmanteló un campo de entrenamiento en la meseta del Pamir, matando a 18 terroristas y capturando a otros 17. Se incautaron además 22 granadas de mano y más de 1.500 granadas que se encontraban en proceso de fabricación, así como algunos explosivos caseros. Durante el enfrentamiento, un oficial resultó muerto y otro fue herido.
2008
El 27 de enero, la policía china acabó con una banda terrorista en Urumqi, la capital regional, matando a dos de ellos y arrestando a otros 15. cinco policías resultaron heridos durante la redada al ser alcanzados por tres granadas caseras lanzadas por los terroristas.
El 7 de marzo, una mujer de 19 años y de etnia uigur intentó un ataque terrorista en un avión de China Southern Airlines que cubría el trayecto de Urumqi a Beijing. El atentado resultó fallido.
El 4 de agosto, dos terroristas armados con pistolas, explosivos, cuchillos y hachas estrellaron un camión contra un grupo de 70 policías que se encontraban realizando los ejercicios de entrenamiento matutino en Kashgar. Un total de 17 personas fueron asesinadas y otras 15 sufrieron heridas graves en un ataque ocurrido tan sólo cuatro días antes de la inauguración de los Juegos olímpicos de Beijing.
El 10 de agosto, una serie de explosiones tuvieron lugar a primera hora de la mañana en algunos supermercados, hoteles y edificios gubernamentales en el distrito de Kuqa, matando a un guardia de seguridad y causando heridas a dos policías. Ocho terroristas fueron abatidos por los disparos de la policía y otros dos se suicidaron con bombas lapa.
