Las organizaciones centrales del PCCh son:

1) El Congreso Nacional del Partido. Es el órgano supremo de dirección y poder de todo el Partido, se celebra cada cinco años, y su convocatoria corre a cargo del Comité Central. Sus atribuciones son: Escuchar y examinar el informe del Comité Central y el de la Comisión Central de Control Disciplinario; discutir y decidir sobre los problemas importantes del Partido; enmendar los Estatutos del Partido; y elegir el Comité Central y la Comisión Central de Control Disciplinario.

2) El Comité Central. Es elegido por el Congreso Nacional del Partido, aplica las resoluciones del mismo congreso durante su receso, dirige todos los trabajos del Partido, representa al PCCh ante el exterior, y cada período de su mandato dura cinco años.

3) El Buró Político del Comité Central, su Comité Permanente y el Secretario General del Comité Central. Son elegidos por la sesión plenaria del Comité Central. El Buró Político del Comité Central y su Comité Permanente ejercen las atribuciones del Comité Central durante el receso de la sesión plenaria de éste. El Secretariado del Comité Central es el organismo de asuntos del Buró Político del Comité Central y su Comité Permanente. El Secretario General del Comité Central responde de convocar las reuniones del Buró Político del Comité Central y de su Comité Permanente y preside el trabajo del Secretariado del Comité Central. Los integrantes de la Comisión Militar Central son decididos por el Comité Central.

4) Además, el PCCh tiene a nivel central la Oficina General del Comité Central, el Departamento de Organización del Comité Central, el Departamento de Propaganda del Comité Central, el Departamento de Enlace Internacional del Comité Central, el Departamento de Trabajo del Frente Unico del Comité Central, la Oficina de Estudio de Políticas del Comité Central y otros departamentos.