En Jiuzhaigou hay 122 especies de vertebrados terrestres, entre los cuales, 21 de animales, 93 de aves, 4 de reptiles y 4 de anfibios. Los animales de protección nacional de grado I incluyen el oso panda, mono dorado, leopardo, ciervo de labio blanco, takin, y monal colirrojo. Los de grado II abarcan el macaco, panda menor, almizclero forestal, goral, faisán orejudo azul, faisán dorado, tragopan de Temminck, grévol chino, perdiz faisán gorgioscura y águila real.